Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms