Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD34P28906 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD34P28906 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD34P28906 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD34P28906 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD34P28906 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD34P28906 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD34P28906 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD34P28906 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD34P28906 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD34P28906 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD34P28906 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD34P28906 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD34P28906 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD34P28906 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD34P28906 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CD34P28906 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD34P28906 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD34P28906 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD34P28906 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD34P28906 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD34P28906 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD34P28906 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD34P28906 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD34P28906 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD34P28906 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD34P28906 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD34P28906 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD34P28906 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD34P28906 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD34P28906 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD34P28906 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD34P28906 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD34P28906 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD34P28906 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD34P28906 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD34P28906 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD34P28906 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD34P28906 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD34P28906 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD34P28906 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD34P28906 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD34P28906 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD34P28906 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD34P28906 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD34P28906 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD34P28906 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD34P28906 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD34P28906 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD34P28906 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD34P28906 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD34P28906 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD34P28906 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD34P28906 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD34P28906 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD34P28906 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD34P28906 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD34P28906 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD34P28906 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD34P28906 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD34P28906 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD34P28906 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD34P28906 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD34P28906 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD34P28906 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD34P28906 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD34P28906 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD34P28906 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD34P28906 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD34P28906 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CD34P28906 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD34P28906 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD34P28906 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD34P28906 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD34P28906 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD34P28906 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD34P28906 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD34P28906 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD34P28906 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD34P28906 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD34P28906 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD34P28906 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD34P28906 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD34P28906 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD34P28906 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD34P28906 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CD34P28906 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD34P28906 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD34P28906 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD34P28906 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD34P28906 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD34P28906 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD34P28906 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD34P28906 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD34P28906 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD34P28906 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD34P28906 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD34P28906 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD34P28906 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD34P28906 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms