Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms