Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms