Protein–RNA interactions for Protein: P24821

TNC, Tenascin, humanhuman

Predictions only

Length 2,201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNCP24821 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNCP24821 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNCP24821 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNCP24821 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNCP24821 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNCP24821 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNCP24821 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNCP24821 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNCP24821 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNCP24821 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TNCP24821 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNCP24821 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TNCP24821 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNCP24821 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNCP24821 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNCP24821 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNCP24821 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNCP24821 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNCP24821 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNCP24821 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNCP24821 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNCP24821 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNCP24821 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNCP24821 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNCP24821 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNCP24821 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNCP24821 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNCP24821 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNCP24821 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TNCP24821 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNCP24821 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNCP24821 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNCP24821 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNCP24821 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNCP24821 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNCP24821 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TNCP24821 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNCP24821 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TNCP24821 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNCP24821 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNCP24821 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNCP24821 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNCP24821 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNCP24821 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNCP24821 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNCP24821 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TNCP24821 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNCP24821 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNCP24821 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNCP24821 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNCP24821 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNCP24821 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNCP24821 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNCP24821 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNCP24821 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNCP24821 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNCP24821 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNCP24821 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNCP24821 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNCP24821 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNCP24821 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNCP24821 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNCP24821 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNCP24821 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNCP24821 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNCP24821 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNCP24821 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNCP24821 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNCP24821 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNCP24821 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNCP24821 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNCP24821 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNCP24821 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNCP24821 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNCP24821 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNCP24821 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNCP24821 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNCP24821 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNCP24821 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNCP24821 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNCP24821 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNCP24821 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNCP24821 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNCP24821 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNCP24821 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TNCP24821 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNCP24821 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNCP24821 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNCP24821 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNCP24821 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNCP24821 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNCP24821 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNCP24821 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNCP24821 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNCP24821 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNCP24821 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNCP24821 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNCP24821 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNCP24821 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNCP24821 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms