Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSHP23434 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSHP23434 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSHP23434 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSHP23434 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSHP23434 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSHP23434 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSHP23434 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSHP23434 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSHP23434 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSHP23434 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSHP23434 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSHP23434 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSHP23434 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSHP23434 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSHP23434 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSHP23434 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSHP23434 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSHP23434 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSHP23434 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSHP23434 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSHP23434 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSHP23434 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSHP23434 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSHP23434 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSHP23434 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSHP23434 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSHP23434 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSHP23434 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSHP23434 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSHP23434 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSHP23434 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSHP23434 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSHP23434 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSHP23434 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSHP23434 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSHP23434 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSHP23434 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSHP23434 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSHP23434 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSHP23434 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSHP23434 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSHP23434 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSHP23434 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSHP23434 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSHP23434 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSHP23434 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSHP23434 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSHP23434 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSHP23434 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSHP23434 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSHP23434 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSHP23434 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSHP23434 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSHP23434 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSHP23434 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSHP23434 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSHP23434 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSHP23434 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSHP23434 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSHP23434 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSHP23434 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSHP23434 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSHP23434 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSHP23434 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSHP23434 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSHP23434 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSHP23434 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSHP23434 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSHP23434 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSHP23434 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSHP23434 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSHP23434 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSHP23434 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSHP23434 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSHP23434 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSHP23434 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSHP23434 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSHP23434 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSHP23434 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSHP23434 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSHP23434 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSHP23434 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
GCSHP23434 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
GCSHP23434 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
GCSHP23434 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
GCSHP23434 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
GCSHP23434 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
GCSHP23434 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
GCSHP23434 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
GCSHP23434 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
GCSHP23434 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
GCSHP23434 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GCSHP23434 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GCSHP23434 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
GCSHP23434 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
GCSHP23434 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GCSHP23434 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
GCSHP23434 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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