Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms