Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms