Protein–RNA interactions for Protein: P22362

CCL1, C-C motif chemokine 1, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL1P22362 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL1P22362 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL1P22362 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL1P22362 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL1P22362 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL1P22362 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL1P22362 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL1P22362 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL1P22362 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL1P22362 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL1P22362 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL1P22362 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL1P22362 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL1P22362 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL1P22362 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL1P22362 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL1P22362 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL1P22362 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL1P22362 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL1P22362 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL1P22362 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL1P22362 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL1P22362 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL1P22362 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL1P22362 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL1P22362 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL1P22362 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL1P22362 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL1P22362 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL1P22362 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL1P22362 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL1P22362 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL1P22362 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL1P22362 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL1P22362 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL1P22362 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL1P22362 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL1P22362 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL1P22362 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL1P22362 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL1P22362 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL1P22362 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL1P22362 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL1P22362 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL1P22362 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL1P22362 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL1P22362 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL1P22362 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL1P22362 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL1P22362 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL1P22362 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL1P22362 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL1P22362 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL1P22362 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL1P22362 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL1P22362 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL1P22362 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL1P22362 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL1P22362 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL1P22362 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL1P22362 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL1P22362 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL1P22362 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL1P22362 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL1P22362 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL1P22362 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL1P22362 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL1P22362 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL1P22362 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL1P22362 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL1P22362 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL1P22362 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL1P22362 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL1P22362 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL1P22362 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL1P22362 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL1P22362 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL1P22362 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL1P22362 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL1P22362 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL1P22362 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL1P22362 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL1P22362 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL1P22362 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL1P22362 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL1P22362 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL1P22362 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL1P22362 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL1P22362 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL1P22362 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL1P22362 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL1P22362 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL1P22362 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL1P22362 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL1P22362 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL1P22362 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL1P22362 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL1P22362 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL1P22362 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL1P22362 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms