Protein–RNA interactions for Protein: P20823

HNF1A, Hepatocyte nuclear factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF1AP20823 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms