Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B1P20020 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP2B1P20020 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP2B1P20020 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP2B1P20020 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP2B1P20020 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP2B1P20020 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP2B1P20020 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP2B1P20020 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP2B1P20020 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B1P20020 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B1P20020 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B1P20020 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B1P20020 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B1P20020 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B1P20020 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B1P20020 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B1P20020 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms