Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms