Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT10P13645 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT10P13645 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT10P13645 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT10P13645 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT10P13645 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT10P13645 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT10P13645 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT10P13645 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT10P13645 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT10P13645 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT10P13645 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT10P13645 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT10P13645 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT10P13645 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT10P13645 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT10P13645 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT10P13645 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT10P13645 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT10P13645 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT10P13645 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT10P13645 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT10P13645 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT10P13645 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT10P13645 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT10P13645 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT10P13645 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT10P13645 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT10P13645 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT10P13645 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT10P13645 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT10P13645 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT10P13645 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT10P13645 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT10P13645 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT10P13645 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT10P13645 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT10P13645 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT10P13645 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT10P13645 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT10P13645 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT10P13645 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT10P13645 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT10P13645 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT10P13645 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT10P13645 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT10P13645 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT10P13645 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT10P13645 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT10P13645 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT10P13645 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT10P13645 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT10P13645 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT10P13645 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT10P13645 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT10P13645 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT10P13645 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT10P13645 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT10P13645 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT10P13645 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT10P13645 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT10P13645 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT10P13645 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT10P13645 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT10P13645 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT10P13645 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT10P13645 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT10P13645 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT10P13645 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT10P13645 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT10P13645 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT10P13645 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT10P13645 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT10P13645 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT10P13645 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT10P13645 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT10P13645 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT10P13645 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT10P13645 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT10P13645 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT10P13645 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT10P13645 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT10P13645 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT10P13645 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT10P13645 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT10P13645 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT10P13645 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT10P13645 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT10P13645 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT10P13645 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT10P13645 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT10P13645 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT10P13645 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT10P13645 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT10P13645 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT10P13645 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT10P13645 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT10P13645 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT10P13645 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT10P13645 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms