Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH1P12830 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH1P12830 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH1P12830 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH1P12830 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH1P12830 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH1P12830 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH1P12830 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH1P12830 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH1P12830 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH1P12830 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH1P12830 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH1P12830 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH1P12830 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH1P12830 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH1P12830 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH1P12830 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH1P12830 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH1P12830 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH1P12830 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH1P12830 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH1P12830 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH1P12830 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH1P12830 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH1P12830 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH1P12830 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH1P12830 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH1P12830 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH1P12830 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH1P12830 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH1P12830 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH1P12830 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH1P12830 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH1P12830 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH1P12830 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH1P12830 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH1P12830 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH1P12830 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH1P12830 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH1P12830 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH1P12830 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH1P12830 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH1P12830 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH1P12830 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH1P12830 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH1P12830 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH1P12830 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH1P12830 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH1P12830 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH1P12830 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH1P12830 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH1P12830 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH1P12830 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH1P12830 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH1P12830 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH1P12830 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH1P12830 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH1P12830 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH1P12830 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH1P12830 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH1P12830 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH1P12830 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH1P12830 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH1P12830 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH1P12830 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH1P12830 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH1P12830 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH1P12830 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH1P12830 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH1P12830 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH1P12830 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH1P12830 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH1P12830 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH1P12830 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH1P12830 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH1P12830 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH1P12830 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH1P12830 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH1P12830 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH1P12830 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH1P12830 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH1P12830 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH1P12830 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH1P12830 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH1P12830 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH1P12830 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH1P12830 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH1P12830 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH1P12830 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH1P12830 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH1P12830 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH1P12830 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH1P12830 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH1P12830 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH1P12830 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDH1P12830 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDH1P12830 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDH1P12830 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDH1P12830 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDH1P12830 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms