Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms