Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD1P0DJD0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms