Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms