Protein–RNA interactions for Protein: P08118

MSMB, Beta-microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMBP08118 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMBP08118 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMBP08118 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMBP08118 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMBP08118 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMBP08118 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMBP08118 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMBP08118 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMBP08118 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMBP08118 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMBP08118 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMBP08118 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMBP08118 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMBP08118 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMBP08118 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMBP08118 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMBP08118 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMBP08118 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMBP08118 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMBP08118 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMBP08118 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMBP08118 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMBP08118 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMBP08118 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMBP08118 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMBP08118 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMBP08118 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMBP08118 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMBP08118 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMBP08118 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMBP08118 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMBP08118 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMBP08118 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMBP08118 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMBP08118 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMBP08118 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMBP08118 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMBP08118 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMBP08118 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMBP08118 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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MSMBP08118 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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MSMBP08118 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMBP08118 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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MSMBP08118 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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MSMBP08118 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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MSMBP08118 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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MSMBP08118 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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MSMBP08118 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MSMBP08118 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MSMBP08118 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MSMBP08118 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MSMBP08118 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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MSMBP08118 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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MSMBP08118 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MSMBP08118 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MSMBP08118 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MSMBP08118 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MSMBP08118 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MSMBP08118 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MSMBP08118 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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