Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RHOP08100 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RHOP08100 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RHOP08100 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RHOP08100 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RHOP08100 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RHOP08100 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RHOP08100 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RHOP08100 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RHOP08100 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RHOP08100 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RHOP08100 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RHOP08100 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RHOP08100 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHOP08100 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHOP08100 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHOP08100 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHOP08100 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHOP08100 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHOP08100 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHOP08100 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHOP08100 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHOP08100 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHOP08100 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHOP08100 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHOP08100 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHOP08100 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHOP08100 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHOP08100 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHOP08100 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHOP08100 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHOP08100 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHOP08100 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHOP08100 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHOP08100 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHOP08100 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHOP08100 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHOP08100 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHOP08100 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHOP08100 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHOP08100 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHOP08100 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHOP08100 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHOP08100 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHOP08100 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHOP08100 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHOP08100 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHOP08100 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHOP08100 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHOP08100 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHOP08100 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHOP08100 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHOP08100 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHOP08100 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHOP08100 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHOP08100 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHOP08100 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHOP08100 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHOP08100 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RHOP08100 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHOP08100 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHOP08100 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RHOP08100 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHOP08100 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHOP08100 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RHOP08100 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHOP08100 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOP08100 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOP08100 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOP08100 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOP08100 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOP08100 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOP08100 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOP08100 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOP08100 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOP08100 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOP08100 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOP08100 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOP08100 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOP08100 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOP08100 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOP08100 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOP08100 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOP08100 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOP08100 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOP08100 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOP08100 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOP08100 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOP08100 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOP08100 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOP08100 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOP08100 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOP08100 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOP08100 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOP08100 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOP08100 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOP08100 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOP08100 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHOP08100 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHOP08100 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms