Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEFLP07196 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NEFLP07196 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEFLP07196 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEFLP07196 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEFLP07196 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEFLP07196 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEFLP07196 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEFLP07196 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEFLP07196 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEFLP07196 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEFLP07196 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEFLP07196 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEFLP07196 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEFLP07196 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEFLP07196 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEFLP07196 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEFLP07196 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEFLP07196 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEFLP07196 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEFLP07196 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFLP07196 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFLP07196 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFLP07196 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFLP07196 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFLP07196 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFLP07196 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFLP07196 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFLP07196 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFLP07196 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFLP07196 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFLP07196 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFLP07196 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFLP07196 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFLP07196 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFLP07196 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFLP07196 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFLP07196 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFLP07196 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFLP07196 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFLP07196 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFLP07196 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFLP07196 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFLP07196 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFLP07196 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFLP07196 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFLP07196 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFLP07196 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFLP07196 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFLP07196 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFLP07196 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFLP07196 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFLP07196 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFLP07196 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFLP07196 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFLP07196 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFLP07196 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFLP07196 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFLP07196 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFLP07196 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFLP07196 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFLP07196 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFLP07196 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFLP07196 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFLP07196 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFLP07196 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFLP07196 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFLP07196 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFLP07196 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFLP07196 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFLP07196 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFLP07196 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFLP07196 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFLP07196 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFLP07196 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFLP07196 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFLP07196 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFLP07196 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFLP07196 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFLP07196 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFLP07196 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFLP07196 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFLP07196 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFLP07196 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFLP07196 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFLP07196 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFLP07196 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFLP07196 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFLP07196 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFLP07196 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFLP07196 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFLP07196 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFLP07196 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFLP07196 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFLP07196 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFLP07196 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFLP07196 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFLP07196 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFLP07196 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFLP07196 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms