Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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