Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms