Protein–RNA interactions for Protein: O75177

SS18L1, Calcium-responsive transactivator, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L1O75177 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms