Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPLO60437 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPLO60437 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPLO60437 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPLO60437 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPLO60437 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPLO60437 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPLO60437 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPLO60437 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPLO60437 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPLO60437 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPLO60437 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PPLO60437 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPLO60437 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPLO60437 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPLO60437 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PPLO60437 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPLO60437 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPLO60437 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPLO60437 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPLO60437 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PPLO60437 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PPLO60437 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPLO60437 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPLO60437 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPLO60437 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPLO60437 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPLO60437 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPLO60437 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPLO60437 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPLO60437 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPLO60437 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPLO60437 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPLO60437 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPLO60437 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PPLO60437 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPLO60437 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPLO60437 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPLO60437 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPLO60437 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPLO60437 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPLO60437 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PPLO60437 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPLO60437 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPLO60437 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPLO60437 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPLO60437 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PPLO60437 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPLO60437 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PPLO60437 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPLO60437 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPLO60437 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPLO60437 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPLO60437 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPLO60437 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPLO60437 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPLO60437 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPLO60437 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPLO60437 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPLO60437 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPLO60437 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPLO60437 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPLO60437 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPLO60437 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPLO60437 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PPLO60437 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPLO60437 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PPLO60437 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPLO60437 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPLO60437 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPLO60437 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPLO60437 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPLO60437 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPLO60437 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPLO60437 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPLO60437 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPLO60437 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPLO60437 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPLO60437 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPLO60437 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPLO60437 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPLO60437 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPLO60437 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPLO60437 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPLO60437 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPLO60437 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPLO60437 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPLO60437 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPLO60437 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPLO60437 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPLO60437 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PPLO60437 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPLO60437 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPLO60437 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPLO60437 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPLO60437 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPLO60437 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPLO60437 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PPLO60437 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPLO60437 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms