Protein–RNA interactions for Protein: O43805

SSNA1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSNA1O43805 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSNA1O43805 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms