Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STX6O43752 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
STX6O43752 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.3■■□□□ 1
STX6O43752 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
STX6O43752 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
STX6O43752 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
STX6O43752 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.3■■□□□ 1
STX6O43752 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.3■■□□□ 1
STX6O43752 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STX6O43752 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
STX6O43752 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
STX6O43752 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
STX6O43752 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STX6O43752 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
STX6O43752 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STX6O43752 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STX6O43752 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STX6O43752 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
STX6O43752 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STX6O43752 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
STX6O43752 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
STX6O43752 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STX6O43752 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STX6O43752 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STX6O43752 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STX6O43752 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
STX6O43752 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
STX6O43752 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.29■■□□□ 1
STX6O43752 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.29■■□□□ 1
STX6O43752 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STX6O43752 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
STX6O43752 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
STX6O43752 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
STX6O43752 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STX6O43752 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STX6O43752 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STX6O43752 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STX6O43752 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
STX6O43752 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
STX6O43752 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
STX6O43752 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.29■■□□□ 1
STX6O43752 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
STX6O43752 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STX6O43752 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STX6O43752 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
STX6O43752 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
STX6O43752 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
STX6O43752 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STX6O43752 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STX6O43752 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STX6O43752 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STX6O43752 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.28■■□□□ 1
STX6O43752 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
STX6O43752 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
STX6O43752 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.28■■□□□ 1
STX6O43752 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STX6O43752 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.28■■□□□ 1
STX6O43752 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
STX6O43752 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
STX6O43752 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
STX6O43752 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.28■■□□□ 1
STX6O43752 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
STX6O43752 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
STX6O43752 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STX6O43752 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
STX6O43752 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STX6O43752 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STX6O43752 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STX6O43752 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STX6O43752 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STX6O43752 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
STX6O43752 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STX6O43752 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
STX6O43752 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.27■■□□□ 1
STX6O43752 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
STX6O43752 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
STX6O43752 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STX6O43752 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
STX6O43752 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STX6O43752 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.27■■□□□ 1
STX6O43752 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.27■■□□□ 1
STX6O43752 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STX6O43752 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STX6O43752 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
STX6O43752 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STX6O43752 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
STX6O43752 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
STX6O43752 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STX6O43752 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STX6O43752 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STX6O43752 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
STX6O43752 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
STX6O43752 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STX6O43752 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
STX6O43752 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
STX6O43752 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STX6O43752 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STX6O43752 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STX6O43752 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
STX6O43752 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms