Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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HOXA3O43365 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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HOXA3O43365 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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HOXA3O43365 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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HOXA3O43365 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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HOXA3O43365 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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HOXA3O43365 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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HOXA3O43365 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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HOXA3O43365 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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HOXA3O43365 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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HOXA3O43365 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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HOXA3O43365 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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