Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CEP290O15078 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CEP290O15078 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CEP290O15078 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CEP290O15078 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CEP290O15078 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CEP290O15078 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CEP290O15078 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CEP290O15078 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CEP290O15078 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CEP290O15078 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CEP290O15078 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CEP290O15078 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CEP290O15078 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CEP290O15078 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CEP290O15078 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CEP290O15078 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CEP290O15078 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CEP290O15078 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CEP290O15078 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CEP290O15078 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CEP290O15078 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CEP290O15078 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CEP290O15078 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CEP290O15078 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CEP290O15078 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CEP290O15078 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CEP290O15078 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CEP290O15078 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CEP290O15078 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CEP290O15078 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CEP290O15078 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CEP290O15078 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CEP290O15078 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CEP290O15078 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CEP290O15078 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CEP290O15078 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CEP290O15078 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CEP290O15078 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CEP290O15078 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CEP290O15078 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CEP290O15078 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CEP290O15078 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CEP290O15078 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CEP290O15078 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CEP290O15078 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CEP290O15078 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CEP290O15078 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CEP290O15078 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CEP290O15078 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CEP290O15078 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CEP290O15078 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CEP290O15078 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CEP290O15078 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CEP290O15078 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CEP290O15078 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CEP290O15078 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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CEP290O15078 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CEP290O15078 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CEP290O15078 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CEP290O15078 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CEP290O15078 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CEP290O15078 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CEP290O15078 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CEP290O15078 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CEP290O15078 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CEP290O15078 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CEP290O15078 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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CEP290O15078 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CEP290O15078 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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CEP290O15078 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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CEP290O15078 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CEP290O15078 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CEP290O15078 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CEP290O15078 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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CEP290O15078 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CEP290O15078 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CEP290O15078 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CEP290O15078 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CEP290O15078 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CEP290O15078 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CEP290O15078 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CEP290O15078 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CEP290O15078 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CEP290O15078 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CEP290O15078 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CEP290O15078 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CEP290O15078 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CEP290O15078 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CEP290O15078 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CEP290O15078 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CEP290O15078 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CEP290O15078 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CEP290O15078 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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