Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD8O14715 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD8O14715 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD8O14715 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD8O14715 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD8O14715 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD8O14715 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD8O14715 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD8O14715 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD8O14715 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD8O14715 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD8O14715 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD8O14715 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD8O14715 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD8O14715 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD8O14715 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RGPD8O14715 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RGPD8O14715 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RGPD8O14715 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RGPD8O14715 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RGPD8O14715 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RGPD8O14715 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD8O14715 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms