Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms