Protein–RNA interactions for Protein: O00303

EIF3F, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3FO00303 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
EIF3FO00303 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms