Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NFKBIEO00221 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NFKBIEO00221 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKBIEO00221 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKBIEO00221 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKBIEO00221 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKBIEO00221 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKBIEO00221 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKBIEO00221 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKBIEO00221 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKBIEO00221 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKBIEO00221 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKBIEO00221 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKBIEO00221 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKBIEO00221 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKBIEO00221 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKBIEO00221 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKBIEO00221 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKBIEO00221 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKBIEO00221 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKBIEO00221 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIEO00221 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIEO00221 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIEO00221 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIEO00221 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIEO00221 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIEO00221 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIEO00221 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIEO00221 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIEO00221 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIEO00221 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIEO00221 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIEO00221 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIEO00221 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIEO00221 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIEO00221 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIEO00221 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIEO00221 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIEO00221 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIEO00221 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIEO00221 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIEO00221 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKBIEO00221 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKBIEO00221 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKBIEO00221 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKBIEO00221 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKBIEO00221 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKBIEO00221 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKBIEO00221 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKBIEO00221 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKBIEO00221 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms