Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms