Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP17L13C9JLJ4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP17L13C9JLJ4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP17L13C9JLJ4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP17L13C9JLJ4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP17L13C9JLJ4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L13C9JLJ4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L13C9JLJ4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L13C9JLJ4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L13C9JLJ4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L13C9JLJ4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L13C9JLJ4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L13C9JLJ4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L13C9JLJ4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L13C9JLJ4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L13C9JLJ4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L13C9JLJ4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L13C9JLJ4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L13C9JLJ4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L13C9JLJ4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L13C9JLJ4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L13C9JLJ4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L13C9JLJ4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L13C9JLJ4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L13C9JLJ4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L13C9JLJ4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L13C9JLJ4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L13C9JLJ4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L13C9JLJ4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms