Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms