Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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