Protein–RNA interactions for Protein: A6NHT5

HMX3, Homeobox protein HMX3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX3A6NHT5 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMX3A6NHT5 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX3A6NHT5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms