Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms