Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Z2

LINC01558, Uncharacterized protein encoded by LINC01558, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01558Q9Y6Z2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms