Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD54BQ9Y620 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAD54BQ9Y620 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAD54BQ9Y620 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAD54BQ9Y620 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAD54BQ9Y620 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
RAD54BQ9Y620 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD54BQ9Y620 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD54BQ9Y620 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD54BQ9Y620 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD54BQ9Y620 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms