Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5S2

CDC42BPB, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42BPBQ9Y5S2 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDC42BPBQ9Y5S2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CDC42BPBQ9Y5S2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
CDC42BPBQ9Y5S2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CDC42BPBQ9Y5S2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
CDC42BPBQ9Y5S2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CDC42BPBQ9Y5S2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CDC42BPBQ9Y5S2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDC42BPBQ9Y5S2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CDC42BPBQ9Y5S2 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDC42BPBQ9Y5S2 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms