Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms