Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms