Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms