Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms