Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms