Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms