Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO3Q9UK99 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms