Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNL1Q9UK58 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms