Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms